首先，9月实际出勤天数与产假天数应分别计算。产假15天按法律规定不计入出勤，但薪资待遇应依法保障。其次，根据《劳动法》及《女职工劳动保护特别规定》，产假是女性职工的合法权益，单位不得因产假扣减薪资或福利。若未依法给予产假待遇，可能面临劳动仲裁和赔偿。最后，未及时处理产假问题，可能导致员工关系紧张，甚至引发法律纠纷，影响企业声誉。
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对于9月实际出勤与产假的计算，常见处理方式是分别统计出勤天数和产假天数。法律上，产假是独立计算的，不计入出勤但应享受相应薪资及福利。因此，建议公司人事部门分开记录，确保员工权益不受损害。选择处理方式时，应遵循法律法规，确保公平公正，避免不必要的法律风险。
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产假与出勤分开算。具体操作：1. 确认9月实际出勤天数，排除产假天数；2. 根据公司规定计算出勤薪资；3. 依法保障产假期间薪资待遇，不得扣减；4. 如有争议，及时沟通并参考《劳动法》解决。