员工对工资有意见应先申请仲裁。依据《劳动争议调解仲裁法》，工资争议需先通过仲裁解决，直接诉讼不被受理。不及时处理可能导致权益受损，如工资拖欠加剧。
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工资有争议先协商。协商不成，准备相关证据申请仲裁；仲裁不服，整理材料向法院起诉。具体操作包括收集工资单、合同等证据，按仲裁流程提交申请，诉讼时遵循法院程序。
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处理工资争议常见方式为协商、仲裁、诉讼。首先尝试与用人单位协商，协商不成则向劳动争议仲裁机关申请仲裁，对仲裁结果不服再提起诉讼。