两月工资合并扣税需符合税法规定，否则可能违法。
分析：根据税法规定，个人所得税的计税依据是纳税人的应纳税所得额，而应纳税所得额的计算需遵循税法规定的原则和方法。如果公司未经员工同意，擅自将两月工资合并后再扣税，可能违反税法中关于工资薪金所得计税的规定，同时也可能侵犯员工的合法权益。
提醒：若公司长期或频繁采取此方式扣税，且未提供合理的解释或依据，可能表明问题比较严重，建议及时咨询专业人士。
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处理方式：
从法律角度，针对两月工资合并扣税的问题，常见的处理方式包括：
1. 与公司财务部门沟通，了解扣税的具体依据和计算方法，核实是否合法合规。
2. 如发现公司行为违法，可向税务部门举报，要求税务部门介入调查。
3. 如因此产生纠纷，可寻求劳动仲裁或诉讼途径解决。

选择方式：
在选择处理方式时，应综合考虑问题的性质、严重程度以及自身的权益保护需求。如问题较为轻微，可优先尝试与公司沟通解决；如问题严重，可考虑向税务部门举报或寻求法律途径解决。
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具体操作：
1. 如认为公司扣税行为违法，应首先收集相关证据，包括工资单、扣税记录等，以便后续维权。
2. 与公司财务部门沟通时，应明确提出质疑，并要求公司提供合法的扣税依据和计算方法。
3. 如公司无法提供合法依据或拒绝改正，可向当地税务部门举报，并提供相关证据材料。税务部门将依法进行调查处理。
4. 如税务部门处理结果不满意或问题未得到解决，可进一步寻求劳动仲裁或诉讼途径解决。在劳动仲裁或诉讼过程中，应充分准备证据材料，维护自身合法权益。

请注意，以上建议仅供参考，具体处理方式应根据实际情况和法律规定进行选择。